Bắt đầu từ ngày 07/8/2025, Thông tư 51/2025/TT-BTC chính thức đưa vào áp dụng 04 hình thức nộp thuế điện tử trong lĩnh vực xuất nhập khẩu, quá cảnh và vận tải. Bài viết này tổng hợp chi tiết từng phương thức, từ nộp qua Cổng thanh toán điện tử hải quan, đến qua ngân hàng hoặc dịch vụ thanh toán trung gian, giúp doanh nghiệp và hộ kinh doanh dễ chọn hình thức phù hợp.
Hướng dẫn 04 hình thức nộp thuế điện tử mới từ 07/8/2025 – Thực hiện theo Thông tư 51
Ngày 24/6/2025, Bộ Tài chính đã ban hành Thông tư 51/2025/TT-BTC quy định về thủ tục giao dịch điện tử trong lĩnh vực thuế đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu, quá cảnh và phương tiện vận tải xuất – nhập – quá cảnh. Quy định này sẽ có hiệu lực từ ngày 07/8/2025.
Tại Chương II của Thông tư, Bộ Tài chính đã hướng dẫn cụ thể về các hình thức nộp thuế điện tử trong phạm vi quản lý của cơ quan hải quan. Từ thời điểm áp dụng, người nộp thuế có thể lựa chọn 1 trong 4 phương thức mới sau:
1. Nộp thuế điện tử qua Cổng thanh toán điện tử hải quan (Khoản 1 Điều 7)
Người nộp thuế truy cập Cổng thanh toán điện tử hải quan để tra cứu khoản phải nộp, lựa chọn mục nộp vào ngân sách nhà nước. Hệ thống sẽ hỗ trợ lập Giấy nộp tiền vào NSNN theo mẫu ban hành kèm Nghị định 11/2020/NĐ-CP. Sau đó, người nộp thuế kiểm tra thông tin, chọn ngân hàng, tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán hoặc Kho bạc Nhà nước, rồi ký số để yêu cầu trích tiền nộp NSNN.
Nếu khoản thuế phải nộp thuộc nhiều tài khoản thu khác nhau, cần lập giấy nộp tiền riêng cho từng tài khoản tương ứng.
Trường hợp khoản nộp chưa có trên Cổng thanh toán điện tử hải quan, người nộp thuế tự điền đầy đủ thông tin vào chứng từ nộp NSNN, chọn đơn vị thanh toán (ngân hàng, trung gian hoặc Kho bạc) và ký số để yêu cầu trích nộp.
Riêng khi nộp phí hải quan, lệ phí hàng hóa hoặc lệ phí phương tiện vận tải quá cảnh cho nhiều tờ khai, người nộp thuế nhập số tờ khai đại diện “9999999999” (gồm 10 số 9) cùng tổng số tiền phí/lệ phí cần nộp trên giấy nộp tiền, rồi ký số để yêu cầu đơn vị thanh toán trích nộp vào NSNN.
2. Nộp thuế điện tử qua ngân hàng hoặc tổ chức trung gian thanh toán phối hợp thu (Điều 8 Thông tư 51/2025/TT-BTC)
Người nộp thuế đăng nhập vào Cổng trao đổi thông tin của ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán đã phối hợp thu với cơ quan hải quan, chọn mục nộp vào ngân sách nhà nước, và lập chứng từ nộp NSNN theo mẫu tại Nghị định 11/2020/NĐ-CP.
Trường hợp nộp phí hải quan, lệ phí hàng hóa hoặc lệ phí phương tiện vận tải quá cảnh cho nhiều tờ khai, thực hiện theo hướng dẫn tại điểm c khoản 1 Điều 7 Thông tư 51/2025/TT-BTC.
Hệ thống của ngân hàng hoặc tổ chức trung gian sẽ đối chiếu dữ liệu trên chứng từ của người nộp thuế với thông tin truy vấn từ Cổng thanh toán điện tử hải quan:
- Nếu thông tin trùng khớp hoàn toàn: đơn vị thu sẽ trích tiền từ tài khoản của người nộp thuế theo quy định tại điểm c khoản 2 Điều 7.
- Nếu thông tin không khớp (trừ số tiền): hệ thống phản hồi để người nộp thuế chỉnh sửa, bổ sung trước khi thực hiện trích nộp.
- Nếu sai số tiền: hệ thống thông báo để người nộp thuế điều chỉnh số tiền, sau đó mới trích chuyển.
- Nếu dữ liệu không tồn tại trên Cổng hải quan: hệ thống phản hồi, người nộp thuế kiểm tra và cập nhật thông tin hoặc liên hệ phản hồi trên Cổng hải quan để được hỗ trợ; sau khi thông tin hợp lệ, ngân hàng/tổ chức trung gian mới tiến hành trích nộp theo quy định.
Trường hợp mất kết nối dữ liệu giữa hệ thống ngân hàng/tổ chức trung gian và Cổng thanh toán điện tử hải quan, người nộp thuế cần cung cấp chứng từ nộp NSNN lập trên Cổng hải quan. Ngân hàng hoặc tổ chức trung gian sẽ quét mã vạch để lấy toàn bộ dữ liệu chứng từ và tiếp tục xử lý theo quy trình tại điểm a khoản 2 Điều 8 Thông tư 51/2025/TT-BTC.
3. Nộp thuế điện tử qua ngân hàng phối hợp thu và có ủy nhiệm thu với Kho bạc Nhà nước (Điều 9 Thông tư 51/2025/TT-BTC)
Người nộp thuế đăng nhập vào cổng trao đổi thông tin của ngân hàng có phối hợp thu và ủy nhiệm thu với Kho bạc Nhà nước để lập chứng từ nộp NSNN theo mẫu ban hành kèm Nghị định 11/2020/NĐ-CP.
Nếu nộp phí hải quan, lệ phí hàng hóa hoặc phương tiện vận tải quá cảnh cho nhiều tờ khai, thực hiện theo điểm c khoản 1 Điều 7 Thông tư 51/2025/TT-BTC.
Quy trình xử lý như sau:
- Thông tin khớp với dữ liệu trên Cổng thanh toán điện tử hải quan: ngân hàng trích tiền từ tài khoản của người nộp thuế và gửi ngay thông tin thu lên Cổng hải quan.
- Thông tin chưa khớp (trừ số tiền): hệ thống ngân hàng thông báo để người nộp thuế chỉnh sửa, bổ sung, sau đó mới trích tiền và truyền thông tin thu lên Cổng hải quan.
- Thông tin sai số tiền: ngân hàng phản hồi để người nộp thuế điều chỉnh số tiền, rồi tiến hành trích nộp theo điểm c khoản 2 Điều 7.
- Không tìm thấy dữ liệu trên Cổng hải quan: ngân hàng phản hồi, người nộp thuế kiểm tra, chỉnh sửa hoặc gửi phản hồi trên Cổng hải quan; sau khi dữ liệu hợp lệ, ngân hàng trích tiền và truyền thông tin thu ngay.
- Mất kết nối dữ liệu giữa ngân hàng và Cổng hải quan: người nộp thuế cung cấp chứng từ nộp NSNN lập trên Cổng hải quan, ngân hàng quét mã vạch để lấy toàn bộ dữ liệu và thực hiện theo điểm a, điểm b khoản 1 Điều 9.
- Sau khi nhận chứng từ nộp tiền liên ngân hàng, ngân hàng kiểm tra, đối chiếu với thông tin truy vấn trên Cổng hải quan và xử lý theo điểm a, b, c khoản 1 Điều 9. Nếu phát hiện sai sót, thực hiện theo Điều 16, 17 và 19 Thông tư 51/2025/TT-BTC.
Trường hợp nộp phí, lệ phí hải quan cho nhiều tờ khai, áp dụng theo điểm c khoản 1 Điều 7 Thông tư này.
4. Nộp thuế điện tử qua ngân hàng hoặc tổ chức trung gian thanh toán chưa phối hợp thu với hải quan (Điều 10 Thông tư 51/2025/TT-BTC)
Người nộp thuế sử dụng hệ thống ứng dụng của ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán chưa ký thỏa thuận phối hợp thu với cơ quan hải quan để lập chứng từ nộp NSNN theo mẫu tại Phụ lục I Nghị định 11/2020/NĐ-CP.
Nếu nộp phí hải quan, lệ phí hàng hóa, hoặc lệ phí phương tiện vận tải quá cảnh cho nhiều tờ khai, thực hiện theo hướng dẫn tại điểm c khoản 1 Điều 7 Thông tư 51/2025/TT-BTC.
Sau khi người nộp thuế hoàn tất giao dịch:
- Ngân hàng hoặc tổ chức trung gian thanh toán (chưa phối hợp thu) chuyển tiền và truyền đầy đủ dữ liệu từ chứng từ nộp NSNN đến ngân hàng nơi Kho bạc Nhà nước mở tài khoản.
- Ngân hàng nơi Kho bạc Nhà nước mở tài khoản tiếp tục truyền đủ thông tin chứng từ nộp NSNN lên Cổng thanh toán điện tử hải quan và thực hiện quy trình theo khoản 2, 3, 4, 5 Điều 9 Thông tư này.
>>> Quan tâm ngay kênh Zalo OA của FastCA để cập nhật những thông tin mới nhất về Thuế, Kế toán và nhận những CTKM siêu hot nhé!
Người nộp thuế có thể lựa chọn những cách nào để nộp thuế điện tử theo Thông tư 51?
Theo khoản 2 Điều 4 Thông tư 51/2025/TT-BTC, người nộp thuế được phép chọn một trong hai phương thức nộp thuế điện tử sau:
- Qua Cổng thanh toán điện tử hải quan: sử dụng phần mềm hoặc công cụ hỗ trợ do cơ quan hải quan cung cấp thông qua Cổng thanh toán điện tử hải quan.
- Qua dịch vụ thanh toán điện tử của ngân hàng hoặc tổ chức trung gian thanh toán: thực hiện theo các hình thức mà đơn vị cung ứng dịch vụ hỗ trợ.
Có thể bạn quan tâm:
>> Gia Hạn Nộp Tờ Khai Thuế TNCN, GTGT Quý 3/2025: Điều Kiện & Mốc Thời Gian Quan Trọng
>> Công Văn 15428/TCHQ-NVTHQ – Gỡ Rối Kịp Thời Bài Toán Hoàn Thuế GTGT Nhập Khẩu Nộp Thừa
>> Đừng Bỏ Qua Mẫu 01 KNNT TĐT Nếu Không Muốn Bị Từ Chối Kết Nối Với Cổng Thanh Toán Điện Tử Hải Quan!
Người nộp thuế có thể lập chứng từ nộp ngân sách nhà nước theo những cách nào?
Theo Điều 4 Thông tư 51/2025/TT-BTC, người nộp thuế được quyền lựa chọn một trong hai phương thức sau để thực hiện việc lập chứng từ nộp ngân sách nhà nước:
-
Sử dụng hệ thống của cơ quan hải quan
-
Truy cập Cổng thanh toán điện tử hải quan; hoặc
-
Sử dụng phần mềm/công cụ hỗ trợ được cơ quan hải quan cung cấp.
-
-
Sử dụng hệ thống của ngân hàng hoặc tổ chức trung gian thanh toán
-
Truy cập ứng dụng thanh toán điện tử do ngân hàng cung cấp; hoặc
-
Truy cập hệ thống của tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán.
-
Tóm lại, Thông tư 51/2025/TT-BTC từ ngày 07/8/2025 triển khai 04 hình thức nộp thuế điện tử giúp người nộp thuế – bao gồm doanh nghiệp, hộ kinh doanh, và cá nhân trong lĩnh vực xuất nhập khẩu, vận tải, quá cảnh – có thể linh hoạt lựa chọn kênh phù hợp. Việc áp dụng điện tử này không chỉ đáp ứng yêu cầu cải cách hành chính, chuyển đổi số mà còn tối ưu hóa quy trình thanh toán thuế: nhanh, minh bạch, an toàn.
Để việc nộp thuế điện tử theo Thông tư 51 trở nên dễ dàng hơn, bạn có thể sử dụng chữ ký số FastCA – Nhanh, an toàn, bảo mật. FastCA còn cung cấp chương trình tư vấn nghiệp vụ miễn phí 1-1 dành riêng cho hộ kinh doanh và doanh nghiệp mới thành lập, giúp xây dựng quy trình nộp thuế tối ưu ngay từ đầu. Hãy liên hệ ngay để được hỗ trợ kịp thời và hiệu quả! Đăng ký ngay: https://khuyenmai.newca.vn/tu-van-thu-tuc-bat-buoc-cho-doanh-nghiep-va-ho-kinh-doanh
Công ty Cổ phần chữ ký số FastCA
Địa chỉ: Tầng 3, tòa nhà Dolphin Plaza, số 28 Trần Bình, Phường Từ Liêm, Thành phố Hà Nội, Việt Nam
Email: info@fastca.vn
Zalo OA: https://zalo.me/4027431816324838319
Website: https://fastca.vn/
