Hóa đơn điều chỉnh kê khai vào kỳ nào? Hướng dẫn kê khai & hạch toán

Hóa đơn điều chỉnh kê khai vào kỳ nào là câu hỏi thường gặp của kế toán khi xử lý hóa đơn điện tử phát sinh sai sót hoặc cần điều chỉnh tăng, giảm số liệu. Việc xác định sai kỳ kê khai rất dễ dẫn đến lệch số liệu giữa tờ khai thuế GTGT và sổ sách, làm phát sinh rủi ro xử phạt. Nhằm tuân thủ đúng quy định mới nhất theo Thông tư 91/2026/TT-BTC (áp dụng từ 01/07/2026), doanh nghiệp cần phân biệt rõ bản chất từng trường hợp điều chỉnh để thực hiện kê khai chính xác, đúng thời điểm. 

Hóa đơn điều chỉnh kê khai vào kỳ nào?

Để trả lời chính xác câu hỏi hoá đơn điều chỉnh kê khai kỳ nào, kế toán cần chia thành hai giai đoạn: trước ngày 01/07/2026 và từ ngày 01/07/2026 trở đi. Đây là mốc thời gian quan trọng do Thông tư 91/2026/TT-BTC chính thức có hiệu lực từ 01/07/2026 mang đến nhiều điểm mới trong xử lý hóa đơn. 

Quy định trước ngày 1/7/2026

Trước ngày 01/07/2026, việc kê khai hóa đơn điều chỉnh cho hóa đơn có sai sót được thực hiện theo quy định tại Khoản 13 Điều 1 của Nghị định 70/2025/NĐ-CP.

Khi doanh nghiệp lập hóa đơn điều chỉnh cho hóa đơn đã lập sai, kế toán xử lý theo nguyên tắc: hóa đơn điều chỉnh được kê khai tại kỳ phát sinh hóa đơn điều chỉnh.

• Trường hợp điều chỉnh tăng: Hóa đơn điều chỉnh làm tăng doanh thu, tăng thuế GTGT đầu ra hoặc làm tăng giá trị đầu vào được khấu trừ thì kê khai tăng theo số chênh lệch.
• Trường hợp điều chỉnh giảm: Hóa đơn điều chỉnh làm giảm doanh thu, giảm thuế GTGT đầu ra hoặc giảm giá trị đầu vào thì kê khai giảm theo số âm.

Nếu hóa đơn điều chỉnh được lập sang kỳ sau, kế toán cần căn cứ vào quy định đang áp dụng tại thời điểm lập hóa đơn điều chỉnh và hồ sơ kê khai thực tế để xử lý phù hợp, tránh kê khai trùng hoặc bỏ sót phần chênh lệch. 

Quy định ngày 1/7/2026

Từ ngày 01/07/2026, khi xác định kê khai hóa đơn điều chỉnh khác kỳ mới nhất, kế toán cần căn cứ đồng thời vào:

• Điều 10 Thông tư 91/2026/TT-BTC về xử lý hóa đơn điện tử.
• Điều 12 Nghị định 252/2026/NĐ-CP về khai bổ sung hồ sơ khai thuế.
• Khoản 6 Điều 23 Nghị định 181/2025/NĐ-CP về khai bổ sung khấu trừ thuế GTGT đầu vào.

Theo nguyên tắc từ 01/07/2026:

• Ảnh hưởng đến số thuế GTGT: Nếu hóa đơn điều chỉnh làm ảnh hưởng đến số thuế GTGT đã kê khai, doanh nghiệp cần thực hiện khai bổ sung vào kỳ gốc (kỳ phát sinh hóa đơn bị điều chỉnh).
• Không ảnh hưởng đến số thuế GTGT: Trường hợp hóa đơn điều chỉnh không làm thay đổi số thuế phải nộp hoặc số thuế GTGT đầu vào được khấu trừ, kế toán kê khai vào kỳ hiện tại (kỳ lập hóa đơn điều chỉnh hoặc kỳ nhận được hóa đơn điều chỉnh tùy vai trò bên bán hay bên mua).

Bảng so sánh quy định kê khai hóa đơn điều chỉnh trước và sau ngày 01/07/2026:

Kết luận: Ở thời điểm hiện tại, doanh nghiệp nên áp dụng quy định sau ngày 01/07/2026 khi xử lý hóa đơn điều chỉnh. Với các hồ sơ cũ phát sinh trước mốc này, kế toán cần kiểm tra lại thời điểm lập hóa đơn gốc, thời điểm lập hóa đơn điều chỉnh, kỳ kê khai đã nộp và mức độ ảnh hưởng đến số thuế để lựa chọn cách xử lý phù hợp. 

Hướng dẫn cách kê khai hóa đơn điều chỉnh khác kỳ, cùng kỳ

Sau khi xác định được giai đoạn áp dụng, kế toán cần phân biệt hóa đơn điều chỉnh được lập cùng kỳ hay khác kỳ với hóa đơn gốc để thực hiện kê khai chính xác. 

Kê khai hóa đơn điều chỉnh cùng kỳ

Kê khai hóa đơn điều chỉnh cùng kỳ là trường hợp ngày lập hóa đơn gốc và ngày lập hóa đơn điều chỉnh đều nằm trong cùng một kỳ kê khai thuế GTGT (tháng hoặc quý). Khi đó, cả bên bán và bên mua đều kê khai cả hóa đơn gốc và hóa đơn điều chỉnh vào chính kỳ phát sinh hai hóa đơn này.

• Điều chỉnh tăng: Kê khai phần giá trị điều chỉnh bằng số dương.
• Điều chỉnh giảm: Kê khai phần giá trị điều chỉnh bằng số âm.

Ví dụ: Công ty Minh An kê khai thuế GTGT theo quý. Trong quý II/2026, công ty lập hóa đơn gốc vào ngày 10/6/2026, sau đó phát hiện sai sót và lập hóa đơn điều chỉnh vào ngày 24/6/2026. Vì cả hai hóa đơn đều phát sinh trong cùng quý II/2026, bên bán và bên mua kê khai cả hóa đơn gốc và hóa đơn điều chỉnh trong kỳ quý II/2026.

Kê khai hóa đơn điều chỉnh khác kỳ

Trường hợp kê khai hóa đơn điều chỉnh khác kỳ xảy ra khi hóa đơn gốc đã phát sinh ở kỳ kê khai trước, nhưng hóa đơn điều chỉnh lại được lập ở kỳ sau.

Dưới đây là chi tiết cách kê khai hóa đơn điều chỉnh khác kỳ từ ngày 01/07/2026 theo Thông tư 91/2026/TT-BTC cho từng trường hợp cụ thể:

Cách kê khai hóa đơn điều chỉnh giảm/tăng

Khi thực hiện kê khai trên tờ khai thuế GTGT, kế toán lưu ý nguyên tắc ghi số liệu như sau:

• Cách kê khai hóa đơn điều chỉnh tăng: Kê khai phần giá trị và tiền thuế điều chỉnh bằng số dương.
• Cách kê khai hóa đơn điều chỉnh giảm: Kê khai phần giá trị và tiền thuế điều chỉnh bằng số âm (ghi dấu trừ “-” phía trước giá trị).
• Hóa đơn điều chỉnh không ảnh hưởng đến số tiền: Các hóa đơn điều chỉnh nội dung như tên hàng hóa, dịch vụ, đơn vị tính, mã số thuế người mua… không làm thay đổi doanh thu, tiền thuế hoặc số thuế được khấu trừ thì không phải kê khai trên tờ khai thuế GTGT.

Hạch toán hóa đơn điều chỉnh khác kỳ bên mua bên bán

Song song với việc xác định tờ khai thuế, việc hạch toán hóa đơn điều chỉnh khác kỳ đòi hỏi kế toán phản ánh đúng bản chất tăng/giảm tài khoản kế toán của từng bên. 

Đối với bên bán

Với bên bán, hóa đơn điều chỉnh thường ảnh hưởng đến doanh thu bán hàng, thuế GTGT đầu ra và công nợ phải thu của khách hàng:

• Trường hợp hóa đơn điều chỉnh tăng doanh thu, thuế GTGT đầu ra:
  • Nợ TK 131, 111, 112: Tổng số tiền tăng thêm phải thu hoặc đã thu
  • Có TK 511: Doanh thu tăng thêm (chưa thuế)
  • Có TK 3331: Thuế GTGT đầu ra tăng thêm
• Trường hợp hóa đơn điều chỉnh giảm doanh thu, thuế GTGT đầu ra:
  • Nợ TK 511 (hoặc tài khoản giảm trừ doanh thu phù hợp theo chính sách kế toán)
  • Nợ TK 3331: Thuế GTGT đầu ra giảm
  • Có TK 131, 111, 112: Tổng số tiền giảm phải thu hoặc hoàn trả cho khách hàng

Đối với bên mua

Với bên mua, hóa đơn điều chỉnh làm thay đổi giá trị hàng mua, chi phí, tài sản, hàng tồn kho hoặc thuế GTGT đầu vào được khấu trừ:

• Trường hợp hóa đơn điều chỉnh tăng giá trị mua vào, thuế GTGT đầu vào:
  • Nợ TK 156, 152, 153, 211, 242, 641, 642…: Giá trị tăng thêm chưa thuế
  • Nợ TK 1331: Thuế GTGT đầu vào tăng thêm
  • Có TK 331, 111, 112: Tổng số tiền phải trả hoặc đã trả thêm
• Trường hợp hóa đơn điều chỉnh giảm giá trị mua vào, thuế GTGT đầu vào:
  • Nợ TK 331, 111, 112: Tổng số tiền được giảm trừ hoặc được hoàn lại
  • Có TK 156, 152, 153, 211, 242, 641, 642…: Giá trị giảm chưa thuế
  • Có TK 1331: Thuế GTGT đầu vào giảm

Hy vọng bài viết đã giúp bạn trả lời được câu hỏi hóa đơn điều chỉnh kê khai vào kỳ nào và nắm rõ quy định tại Thông tư 91/2026/TT-BTC. Việc thực hiện đúng cách kê khai hóa đơn điều chỉnh giảm và tăng không chỉ giúp doanh nghiệp minh bạch số liệu mà còn hạn chế tối đa rủi ro bị xử phạt vi phạm hành chính về thuế. Đừng quên thường xuyên cập nhật các chính sách mới nhất để tối ưu hóa quy trình kế toán tại đơn vị mình.