Năm 2025 mang đến những quy định mới, tác động không nhỏ đến quy trình và thời điểm được khai bổ sung hồ sơ hải quan, đặc biệt trong các tình huống phát sinh sau thông quan như khi có sự thiếu hụt hàng hóa. Việc nắm rõ các mốc thời gian và thủ tục cụ thể là cực kỳ quan trọng để doanh nghiệp tránh bị xử phạt và đảm bảo tính chính xác của hồ sơ.
Vậy, theo các quy định mới của năm 2025, doanh nghiệp được phép khai bổ sung hồ sơ hải quan vào thời điểm nào, và cần thực hiện thủ tục bổ sung sau thông quan khi thiếu hàng gửi ra sao? Bài viết này sẽ đi sâu phân tích những hướng dẫn mới nhất, giúp các doanh nghiệp thực hiện đúng quy trình khai báo và xử lý hiệu quả các trường hợp phát sinh.
Khai bổ sung hồ sơ hải quan là gì? Những điều cần biết
Căn cứ theo khoản 9 Điều 1 Thông tư 39/2018/TT-BTC (sửa đổi Thông tư 38/2015/TT-BTC), việc khai bổ sung hồ sơ hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu được hiểu là quá trình điều chỉnh, cập nhật lại các thông tin trên tờ khai hải quan, kèm theo việc nộp các chứng từ có liên quan đến nội dung điều chỉnh đó.
Thời điểm nào được phép khai bổ sung hồ sơ hải quan trong năm 2025?
Theo quy định tại khoản 9 Điều 1 Thông tư 39/2018/TT-BTC (sửa đổi, bổ sung Thông tư 38/2015/TT-BTC về thủ tục hải quan, kiểm tra – giám sát hải quan, thuế xuất nhập khẩu và quản lý thuế đối với hàng hóa xuất – nhập khẩu), việc khai bổ sung hồ sơ hải quan được hiểu là quá trình điều chỉnh, cập nhật lại thông tin trên tờ khai hải quan kèm theo việc nộp các chứng từ có liên quan đến nội dung thay đổi.
Ngoại trừ những chỉ tiêu thông tin không được phép điều chỉnh theo quy định tại mục 3 Phụ lục II ban hành kèm Thông tư 39/2018/TT-BTC, người khai hải quan có thể thực hiện bổ sung các thông tin trên tờ khai trong những trường hợp cụ thể được pháp luật cho phép.
*Trường hợp khai bổ sung trong quá trình thông quan:
– Trước khi cơ quan hải quan thông báo kết quả phân luồng tờ khai, người nộp thuế hoặc người khai hải quan có thể chủ động thực hiện khai bổ sung hồ sơ hải quan.
– Nếu sau khi nhận được thông báo phân luồng nhưng trước thời điểm thông quan, người nộp thuế hoặc người khai hải quan phát hiện thông tin sai lệch thì vẫn được phép khai bổ sung, tuy nhiên sẽ bị xử lý theo quy định hiện hành.
– Trường hợp trong quá trình kiểm tra hồ sơ hoặc kiểm tra hàng hóa thực tế, nếu cơ quan hải quan phát hiện nội dung kê khai không phù hợp với hàng hóa hoặc chứng từ, người khai hải quan sẽ phải khai bổ sung theo yêu cầu và chịu trách nhiệm xử lý vi phạm theo quy định của pháp luật.
*Khai bổ sung sau khi hàng hóa đã được thông quan:
Ngoại trừ các nội dung liên quan đến giấy phép xuất – nhập khẩu và các yêu cầu kiểm tra chuyên ngành như kiểm định chất lượng, kiểm dịch, an toàn thực phẩm, y tế hay văn hóa,… thì người khai hải quan vẫn có thể thực hiện khai bổ sung trong các trường hợp sau:
– Trường hợp phát hiện sai sót sau khi hàng hóa đã thông quan, người nộp thuế hoặc người khai hải quan được phép điều chỉnh thông tin trong thời gian tối đa 60 ngày kể từ ngày thông quan và trước khi cơ quan hải quan ra quyết định kiểm tra sau thông quan hoặc thanh tra.
– Nếu phát hiện sai sót sau thời hạn 60 ngày kể từ ngày thông quan nhưng vẫn chưa có quyết định kiểm tra sau thông quan hoặc thanh tra của cơ quan hải quan thì vẫn được khai bổ sung. Tuy nhiên, lúc này người khai hải quan sẽ bị xử lý theo quy định hiện hành của pháp luật.
Gửi thiếu hàng sau thông quan: Người khai hải quan cần chuẩn bị gì khi khai bổ sung?
Căn cứ theo điểm 9 Điều 1 Thông tư 39/2018/TT-BTC, việc khai bổ sung các thông tin trên tờ khai hải quan điện tử và nộp chứng từ liên quan được thực hiện qua hệ thống với các loại giấy tờ như sau:
– Bản chụp văn bản xác nhận từ phía người gửi hàng về việc hàng hóa bị gửi thiếu;
– Bản chụp hợp đồng và phụ lục hợp đồng thể hiện nội dung điều chỉnh liên quan đến thông tin hàng hóa hoặc giá trị hàng hóa, hoặc các tài liệu tương đương theo quy định pháp luật;
– Bản chụp hóa đơn thương mại có cập nhật các thay đổi về hàng hóa và giá trị;
– Bản chụp vận đơn hoặc chứng từ vận tải khác (áp dụng nếu việc khai bổ sung liên quan đến các chỉ tiêu như số container, kiện hàng hoặc trọng lượng hàng rời chưa rời khỏi khu vực giám sát hải quan);
– Bản chụp chứng từ thanh toán (nếu có);
– Kết quả giám định từ tổ chức cung cấp dịch vụ giám định về số lượng hàng nhập khẩu thực tế.
Như vậy, trong trường hợp phát sinh khai bổ sung do hàng hóa bị gửi thiếu sau thông quan, người kê khai cần chuẩn bị đầy đủ các chứng từ nêu trên để hoàn thiện hồ sơ theo đúng quy định.
Hướng dẫn thủ tục khai bổ sung hải quan sau thông quan khi phát hiện thiếu hàng
Theo quy định tại khoản 9 Điều 1 Thông tư 39/2018/TT-BTC, trình tự thực hiện khai bổ sung hồ sơ hải quan sau khi thông quan trong trường hợp thiếu hàng được thực hiện như sau:
Bước 1:
Người khai hải quan thực hiện việc cập nhật các chỉ tiêu cần điều chỉnh trên tờ khai hải quan điện tử và gửi kèm các chứng từ liên quan thông qua hệ thống khai hải quan điện tử. Hồ sơ này sau đó sẽ được cơ quan hải quan tiếp nhận để xử lý.
Bước 2:
Trong trường hợp hàng hóa vẫn nằm trong khu vực chịu sự giám sát hải quan (kể cả đang trong thời gian được phép đưa về bảo quản), cơ quan hải quan có thể tiến hành kiểm tra thực tế hàng. Việc kiểm tra phải tuân thủ thời gian quy định tại khoản 2 Điều 23 của Luật Hải quan năm 2014.
Bước 3:
Căn cứ kết quả kiểm tra, cơ quan hải quan sẽ tiến hành các bước xử lý theo đúng quy trình và quy định pháp luật hiện hành.
Việc nắm rõ thời điểm và thủ tục khai bổ sung hồ sơ hải quan năm 2025 là yếu tố then chốt giúp doanh nghiệp tuân thủ đúng quy định, đặc biệt khi xử lý các trường hợp phát sinh như thiếu hàng gửi sau thông quan.
Hy vọng bài viết này đã cung cấp những hướng dẫn chi tiết, giúp bạn thực hiện đúng quy trình và tránh những sai sót không đáng có. Luôn cập nhật các thông tư, nghị định mới nhất để đảm bảo hoạt động xuất nhập khẩu của doanh nghiệp luôn diễn ra suôn sẻ và hiệu quả.
Công ty Cổ phần chữ ký số FastCA
Địa chỉ: Tầng 3, tòa nhà Dolphin Plaza, số 28 Trần Bình, P. Mỹ Đình 2, Q. Nam Từ Liêm, Hà Nội
Email: info@fastca.vn
Zalo OA: https://zalo.me/4027431816324838319
Website: https://fastca.vn/
